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我国输入性疟疾主要疫源地有非洲、东南亚地区 。

非洲大部分地区疟疾流行较为严重，特别是撒哈拉以南非洲地区，疟原虫感染率高，当地医疗卫生条件有限、蚊虫滋生环境适宜等因素导致疟疾广泛传播，大量在非洲务工、经商、旅行的中国公民易感染疟疾并带回国内。

东南亚地区如缅甸、柬埔寨、老挝等国家也是疟疾高发区。

这些国家与我国云南等边境地区接壤，人员往来频繁，包括跨境贸易、劳务输出等活动，增加了疟疾输入我国的风险 。